أنشئت الأكاديمية بموجب القرار رقم /2935/ لعام 1971، تحت اسم "المعهد القومي للتدريب على أعمال الطيران المدني"، وتم بموجب القرار رقم /140/ لعام 2009، تحويل المعهد إلى شركة قابضة باسم "الأكاديمية المصرية لعلوم الطيران"، جمهورية مصر العربية.
وهي مؤسسة تعليمية تابعة لـ"وزارة الطيران المدني"، تعمل بنظام الشركات القابضة بهدف إعداد وتأهيل الكوادر العلمية والفنية في مجالات أنشطة التدريب على الطيران، وتضم الأكاديمية 3 كليات، هي: "الكلية المصرية للطيران"، و"كلية المراقبة الجوية"، وكلية خاصة بالدراسات المتخصصة، تقوم بتخريج مهندسين صيانة طائرات.