تأسست "الهيئة العامة للشؤون الإسلامية والأوقاف والزكاة" بتاريخ 9 أكتوبر/تشرين الأول 2006.وهي هيئة عامة، تتبع "مجلس الوزراء"، تهدف إلى الوصول إلى مجتمع واع دينياً وقادر على التعامل مع التحديات المعاصرة والمستجدة، والنهوض بالمساجد وتطوير العاملين بها، وضمان تيسير خدمات الحج والعمرة، وإحياء سنة الوقف والمحافظة عليه وتنميته، والارتقاء بأداء الهيئة إلى أفضل الممارسات العالمية، وبناء منظومة من السياسات والتشريعات لتنظيم عمل المؤسسات ذات العلاقة بالشؤون الإسلامية، وبناء منظومة من الشراكات الاستراتيجية التي تعزّز دور الهيئة ورسالتها.يوكل إلى الهيئة الإرشاد والتوجيه الديني في الدولة ترسيخاً لمبدأ الوسطية، ونشر الثقافة الإسلامية وتنمية الوعي الديني، وإدارة المساجد والإشراف عليها، وإبداء الرأي في المسائل الشرعية، وتنظيم شؤون الحج والعمرة، وإقامة المؤتمرات والندوات والاحتفالات والمسابقات الدينية، والإشراف على طبع المصحف الشريف وتوزيعه، والإشراف على مراكز تحفيظ القرآن والمعاهد الدينية، ومراجعة المطبوعات والتسجيلات الدينية، وتأهيل المطبوعات والتسجيلات الدينية، وتأهيل وإعداد الأئمة والخطباء، ومنح تصاريح العمل للأئمة والوعاظ والخطباء، ومنح التراخيص للمراكز الدينية وحملات الحج والعمرة، والإشراف على الأوقاف الواقعة ضمن اختصاصات الهيئة وتنمية واستثمار أموالها، وترسيخ سنة الوقف والدعوة لها بما يحقق المقاصد الشرعية لخدمة المجتمع.كانت تعرف باسم "الهيئة العامة للشؤون الإسلامية والأوقاف".