تأسست "سلطة مدينة دبي الطبية" عام 2011، وهي الجهة المنظمة والمشرفة على "مدينة دبي الطبية". ومن مهام السلطة إنشاء وإدارة البنية التحتية في "مدينة دبي الطبية"، وإنشاء أو المشاركة في إنشاء كليات الطب ومراكز الأبحاث والدراسات الطبية ومؤسسات ومدارس التمريض، إضافةً إلى التعاون مع بعض الجامعات والمؤسسات الطبية والصحية العالمية بغرض تطوير الخدمات الطبية، وإنشاء أو المشاركة في إنشاء العيادات والمراكز التشخيصية وشركات الأدوية والمعدات الطبية، ومراكز إعادة التأهيل، ومراكز الأغذية والمراكز الصحية والعلاجية، والمنتجعات الطبية، والأندية الصحية والرياضية. ومن صلاحيات السلطة الرقابة والتفتيش على مؤسسات المدينة الطبية، والاتفاق مع المناطق الحرة بشأن تمكين مؤسسات المدينة من مزاولة أنشطتها داخل تلك المناطق، وتزويد مؤسسات المدينة بما تحتاجه من الإداريين والفنيين والمهنيين والحرفيين  وفقاً للشروط المتفق عليها مع تلك المؤسسات، وتأجير وتمليك الأراضي والمباني داخل المدينة لأية مؤسسة في المدينة الطبية لتمكينها من مزاولة نشاطها، وتوفير الخدمات الطبية والصحية بأنواعها كافة في المدينة.