يشغل يونس حاجي الخوري منصب وكيل وزارة المالية في دولة الإمارات العربية المتحدة منذ عام 2007، ويضطلع بدور محوري في رسم السياسات المالية والإشراف على الهيئات الاقتصادية المختلفة. كما يشغل عضوية مجلس إدارة شركات ومؤسسات مالية واستثمارية هامة، منها شركة دانة غاز، مصرف الإمارات المركزي، مصرف الإمارات للتنمية، ومجلس أبوظبي للاستثمار.
يشارك الخوري في مجموعة من الهيئات والمؤسسات الاستراتيجية، بما في ذلك عضوية مجلس جامعة الإمارات العربية المتحدة، ومجلس الإمارات للتوازن بين الجنسين، وعضوية مجلس الإدارة واللجان التنفيذية في الهيئة العامة للمعاشات والتأمينات الاجتماعية، إضافةً إلى منصبه نائب رئيس مجلس إدارة شركة الاتحاد للمعلومات الائتمانية، وعضوية صندوق النقد العربي.
امتدت مسيرته العملية لتشمل العديد من المناصب في مؤسسات وطنية وإقليمية، مثل نائب رئيس مجلس إدارة مصرف الإمارات للتنمية، وعضوية مجلس إدارة شركة الإمارات للبترول، الهيئة الوطنية للمواصلات، وشركة الإمارات للاتصالات المتكاملة "دو".
حاصل على ماجستير في إدارة الهندسة من جامعة نورث ويست، وبكالوريوس في هندسة الحاسب من جامعة بوسطن، بالإضافة إلى شهادة برنامج الإدارة التنفيذية من جامعة هارفارد للأعمال في الولايات المتحدة الأمريكية.